Фаза HD-C18 лучше всего подходит для разделения сильно гидрофобных небольших молекул с небольшими структурными различиями, например изомеров. Плотность цепей C18 на поверхности гибридных частиц органокремнезема выше по сравнению с Scepter HD-C18. В результате молекулы, которые из-за своего размера могут проникать между цепями C18, испытывают больше взаимодействий, чем молекулы, чья молекулярная структура не позволяет им проникать между ними или позволяет лишь частично. Таким образом, молекулы с небольшими структурными различиями могут быть разделены лучше.