Фаза HD-C18 лучше всего подходит для разделения сильно гидрофобных малых молекул с небольшими структурными различиями, например изомеров. Плотность цепей C18 на поверхности частиц органосиликатного гибрида выше, чем у Scepter C18. В результате молекулы, которые могут поместиться между цепями C18 благодаря своему размеру, испытывают больше взаимодействий, чем молекулы, чья молекулярная структура не позволяет им поместиться или позволяет лишь частично. Это позволяет легче разделять молекулы с небольшими структурными различиями.