Фаза HD-C18 лучше всего подходит для разделения сильно гидрофобных небольших молекул с небольшими структурными различиями, например, изомеров. Плотность цепей C18 на поверхности органосиликатных гибридных частиц выше по сравнению с Scepter HD-C18. В результате молекулы, которые по размеру могут проникнуть между цепями C18, испытывают больше взаимодействий, чем молекулы, чья молекулярная структура не позволяет им проникнуть между ними или позволяет лишь частично. Таким образом, молекулы с небольшими структурными различиями могут быть лучше разделены.